La costruzione di canali artificiali ha reso nei secoli passati il territorio euganeo un punto fondamentale per i traffici commerciali. Oggi le vie d’acqua e i numerosi laghetti rappresentano importanti siti di interesse naturalistico.
Il fiume Bacchiglione nasce ai piedi delle Prealpi vicentine e percorre un ampio tratto della Pianura Padana, attraversando Padova e Vicenza. Con la sua lunghezza di 118 Km ha rappresentato sin dall’antichità un’importante via di comunicazione per le attività produttive e commerciali.
Nei pressi di Battaglia Terme si trova il Museo Civico della Navigazione Fluviale situato al limite della Riviera Ortazzo. Raccoglie, al suo interno, storie, materiali e ricordi attraverso i quali si possono riscoprire tradizioni passate.
Il Biotopo di San Daniele o Lago Verde è una delle rare zone umide dei Colli Euganei, si può raggiungere facilmente in bicicletta percorrendo l’anello ciclabile dei Colli Euganei che collega Montegrotto Terme con il territorio del comune di Torreglia dove di confine si trova il lago.
La Cascata Schivanoia è uno dei siti naturalistici più suggestivi del territorio euganeo. Nei pressi di Castelnuovo di Teolo si trova una piccola cascata immersa nel bosco. La cascatella si chiama Cascata di Schivanoia perché identifica la località dove nel XV secolo la ricca famiglia dei Capodilista aveva vasti possedimenti fondiari e una casa di villeggiatura; in passato il termine schivanoia indicava luoghi di svago in campagna.
La Fonte Canola è una piccola sorgente di acqua dolce che sgorga nei pressi del borgo di Teolo, lungo il pendio occidentale del monte della Madonna. La fonte è alimentata da un piccolo ruscello il quale raccoglie acque di origine meteorica ed è chiamata “Cannula”.
La Fonte Regina è una particolare conformazione geologica dei Colli Euganei che ha permesso la formazione di molteplici sorgenti distribuiti lungo i versanti. Le sue fredde acque perenni mantengono una temperatura costante intorno ai 14°C.
Il Lago della Costa si trova lungo il versante dei Colli Euganei, nella vallata del borgo di Arquà Petrarca. L’importanza è dal punto di vista naturalistico-archeologico perché oggi le rive appaiono abbandonate, la vegetazione è palustre con prevalenza di canneti e salici.
Il Lago di Lispida si trova tra Monselice e Battaglia Terme, si estende ai piedi del versante orientale del piccolo monte dove prende il nome. È alimentato da polle di acqua solforosa calda, il suo fondale fangoso rappresenta una riserva preziosa perché fornisce gran parte del fango termale utilizzato per scopi terapeutici dagli stabilimenti delle Terme Euganee.